全市有野生、栽培及引种成功的高等植物 1600 余种及变种、亚种、变型，分属 191 科、775 属，陆生脊椎动物 4 纲 300 多种，浮游植物 8 门 99 种属，浮游动物四大类 71 种。农作物害虫天敌有3 纲 39 科 113 种。粮食作物主要有小麦、玉米、红薯（即地瓜）、高粱、大豆、大麦等。经济作物主要有花生、芝麻、棉花、大麻、烟草、蔬菜等。木本植物分属 71 科、471种（变种）。用材树种主要有黑杨、毛白杨、刺槐、榆树（又称白榆）、泡桐等 50 余种。经济林树种主要有苹果、樱桃、核桃、桃、板栗、大枣、杏等 30 余种，其中“肥城桃”“泰山板栗”“新泰苹果”“宁阳大枣”等被批准为国家地理标志证明商标和农业农村部农产品地理标志产品。观赏树种有 40 余种，主要有雪松、圆柏、银杏、槐树（又称国槐）等。以泰山命名的珍稀树木有泰山花楸、泰山柳、泰山椴、泰山盐肤木等 20多种，基本上都属于濒危保护级别。古树名木 1.95 万株，隶属 27 科 45种，主要有汉柏、唐槐、六朝松等。牧草分属 35 科、95 属、118 种，以禾本科最多，菊科次之。全市天然草场年产鲜草约 2.5 亿千克。中药材分属 110 科、448 种，有 10 余种属于道地药材，为具有全国知名度的药材，如泰山灵芝、泰山何首乌、泰山四叶参、泰山黄精、泰山紫草、汶香附、肥城栝楼、穿山龙、白花丹参、徐长卿等。泰山“四大名药”（泰山何首乌、泰山四叶参、泰山黄精、泰山紫草）被列为国家地理标志证明商标。肥城栝楼属地方名优品种。水生植物 40 种，分属 2 门、18 科、30 属，集中分布于东平“三湖”，主要有藕、芡实、菱角、苇、蒲草等。畜禽品种 50多个，主要有牛、马、羊、猪、鸡、鸭等，其中东平、宁阳一带的鲁西黄牛为全国四大良种牛之一，役肉兼用。小尾寒羊为稀有品种，主要产地东平县被列为全省小尾寒羊保种基地。水生动物以东平湖、稻屯洼为最多，主要有中华绒螯蟹（毛蟹）、鳖、虾、蚌等。鱼类分属 8 目、15 科、48 种，主要有鲫、鲤、鲢、草鱼等，其中泰山赤鳞鱼（又名螭霖鱼）、东平湖大青虾、东平湖鲤鱼为国家地理标志产品，“泰山金螭霖”被列为国家地理标志证明商标。野生动物有两栖动物 7 种、爬行动物 12 种、鸟类 200 多种。珍稀动物有属国家一级保护动物的白鹳、大鸨、梅花鹿（引进品种）等。